ESCO二級生物安全柜的污染控制性能是安全柜確保所有的危險顆粒不從操作窗口逃逸出去的能力。安全柜的防護作用基本取決于氣流方式，包括適合的氣流方向和速度。世界上理想的污染控制性能測試是EN中所使用的KI-discus測試。需注意生物安全柜也許可以通過所有的氣流測試，但不一定能通過污染控制性能測試。ESCO具有KI-discus測試能力，其擁有完整的測試設施，所有型號的生物安全柜都通過污染控制性能的檢測。
近年出現多起生物實驗室感染事故的發生，使相關部門、廣大科研工作者和實驗室工作人員對生物危害有了較為深刻的認識。加強生物安全柜正確使用，防止實驗人員受到感染至關重要。
ESCO二級生物安全柜使用時柜內不放與本次實驗無關的物品，操作前應將實驗所需的全部物品移入安全柜，避免操作中雙臂頻繁穿過氣幕破壞氣流。并且在移入前用70%酒精擦拭表面消毒，消毒工作臺面。柜內物品擺放應做到清潔區、半污染區與污染區分開，在柜內擺放的物品應該盡量呈橫向一字擺開，操作中物品取用方便，避免回風過程中造成交叉污染。物品應盡量靠后放置，但不得擋住氣道口，以免干擾氣流正常流動。
ESCO二級生物安全柜要做好定期的清潔消毒，柜內臺面污染物可在工作完成且紫外燈消毒后用2%的84消毒液擦拭。也可用70%酒精并對工作臺面、后壁、側壁，觀察窗的內側進行消毒。柜體外表面則應每天用1%的84消毒液擦拭。甲醛蒸汽熏蒸是清除污染常用的方法。
